InnoDB의 장점:
1. 트랜잭션 지원: InnoDB는 ACID 특성을 지원하여 데이터 일관성과 안전한 병행 처리를 제공합니다.
2. 외래 키 제약: InnoDB는 외래 키 제약을 지원하여 데이터 무결성을 강화할 수 있습니다.
3. 공유 옵티미스틱 락: InnoDB는 여러 개의 동시 트랜잭션에서 충돌이 발생하지 않도록 하는 공유 옵티미스틱 락을 사용하여 성능을 향상시킬 수 있습니다.
4. 버전 관리: InnoDB는 다중 버전 동시성 제어(MVCC)를 사용하여 한 트랜잭션이 데이터를 변경하는 동안 다른 트랜잭션의 읽기 작업을 허용합니다.

MyISAM의 장점:
1. 속도: MyISAM은 단순하고 가벼운 스토리지 엔진이므로 일반적으로 읽기 작업에 대해 InnoDB보다 빠른 성능을 제공할 수 있습니다.
2. 전체 텍스트 검색: MyISAM은 전체 텍스트 검색(Full-Text Search) 기능을 지원하여 효과적인 텍스트 검색이 가능합니다.
3. 압축 테이블: MyISAM은 압축 테이블 기능을 제공하여 디스크 공간을 절약할 수 있습니다.

InnoDB의 단점:
1. 상대적으로 높은 저장 공간 요구: InnoDB는 트랜잭션 로그, 클러스터드 인덱스 등 추가적인 공간을 필요로 하기 때문에 저장 공간 요구가 더 크다는 단점이 있습니다.
2. 성능 오버헤드: InnoDB는 ACID 특성과 동시성 제어를 위한 추가 작업을 수행하므로 상대적으로 CPU 및 메모리 리소스를 더 많이 사용합니다.

MyISAM의 단점:
1. 트랜잭션 및 외래 키 지원 부족: MyISAM은 트랜잭션과 외래 키 제약을 지원하지 않습니다. 따라서 데이터 일관성과 안전한 병행 처리를 보장하기 어렵습니다.
2. 충돌 가능성: MyISAM은 테이블 단위로 락을 거는 것이므로 여러 개의 동시 쓰기 작업이 발생할 경우 충돌이 발생할 수 있습니다.
3. 복구 기능 부족: MyISAM은 복구 기능이 제한적이며, 크래시 시 데이터 손실 가능성이 있습니다.

결론적으로, InnoDB는 트랜잭션과 데이터 무결성을 중요시하는 애플리케이션에 적합하며, MyISAM은 간단한 읽기 중심의 애플리케이션 또는 텍스트 검색이 주요 요구사항인 경우 유용할 수 있습니다. 그러나 일반적으로 InnoDB를 사용하는 것이 안전성과 확장성 면에서 권장됩니다.

저의 경험에 의하면 MyISAM은  업데이트요청이 적은 BBS같은기능에 적합하고 InnoDB는 업데이트가 자주 일어나는 기능에 적합한거 같습니다.