출력할때..

$content = $content // 내용이라고 치면...

$new_content = str_replace("[굵게]","<b>",$content);
$new_content = str_replace("[/굵게]","</b>",$content);

echo $new_content;
너무 원시적인가요?

<!-- 내용 출력 -->
<span class=content>
<?
$content = $content;
$new_content = str_replace("[/굵게]","</b>",$content);
$new_content = str_replace("[굵게]","<b>",$content);

echo $new_content;
?>
</span>

이렇게 넣었더니 [굵게] 이부분만 적용되서
진하게[/굵게] 이렇게 출력됩니다.

위에 지윤지영님이 남기신 코멘트처럼 순서대로..
1번째에 [굵게] 2번째에 [/굵게] 로 쓰세요.
순서가 바뀌에 [/굵게]부분이 적용이 안되어서 그렇습니다.

$new_content = str_replace("[굵게]","<b>",$content);
$new_content = str_replace("[/굵게]","</b>",$new_content);

아니면

$new_content = str_replace("[/굵게]","</b>",$content);
$new_content = str_replace("[굵게]","<b>",$new_content);