다른페이지로 가서 파이어버그나 크롬 개발도구로 보시면
<a name="g4_head"></a> 아래에 " " 공백이 들어가 있습니다.
헤드부분에 변수 처리를 하신건 아닌지요 해당 변수가 공백을 echo 하는건 아닌지 모르겠네요

아무튼 그부분 없애니까 간격이 똑같아 집니다. 헤드 아래나 바디 상단을 체크 해보세요

저도 같은 증상을 겪었었는데, head.php 보시면 가끔씩 $nbsp 라인이 들어가 있는부분이 있습니다...
그거 지워주시면 되더라구요 ;)
그 라인 자체가 아마 table로 감싸져 있던거 같은데....정확히 기억이 나진 않네요...ㅠㅠ

어떻게 된건진 모르겠는데 시간이 지나니까 그냥 해결되는군요