bbs/memo_form_update.php 파일 수정하시면 됩니다.

if (!$is_admin) {
insert_point($member[mb_id], (int)$config[cf_memo_send_point] * (-1), "{$recv_mb_nick}({$recv_mb_id})님께 쪽지 발송", "@memo", $recv_mb_id, $me_id);
}

위 소스면 관리자가 쪽지를 발송할 때 같네요.
if ($recv_mb_id != 'admin') {
insert_point($member[mb_id], (int)$config[cf_memo_send_point] * (-1), "{$recv_mb_nick}({$recv_mb_id})님께 쪽지 발송", "@memo", $recv_mb_id, $me_id);
}

admin는 관리자아이디입니다.
관리자 권한을 가져와서 해야하겠지만 일단 저게 간단하게 할 수 있는방법입니다.