최근 라이브러리를 고치시면 될듯한데..음...

답글 기준이 어디였더라..wr_reply였던가.. 그건 또확인해봐야 알겠군요.
입으로 글작성 답변후 디비테이블 비교해보심 답이 금방 나올것입니다.

$sql = " select * from $tmp_write_table where wr_is_comment = 0 order by wr_id desc limit 0, $rows ";

-->

$sql = " select * from $tmp_write_table where wr_is_comment = 0 order by wr_reply, wr_id desc limit 0, $rows ";

우선권을 살짝 바꾸시면 됩니다. 고유값 wr_id를 우선으로 하나 첫째적으로 정렬의 규칙을 리플일 경우 wr_id를 무시하고 정렬하라는 것입니다.

게시판의 필드 정렬을 자세히 보는것도 하나의 방법인듯합니다.

아..그리고 최근 라이브러리를 하나더 추가하시고 하심 좋을듯하네요.

function latest_reply($skin_dir="", $bo_table, $rows=10, $subject_len=40, $options="")
{
~~~ 기존의 내용에서 정렬부분 정정 한내용 ~~
}

그누보드 / lib / latest.lib.php 파일에 아래와 같이 했더니
원본글만 보이고 답글이 안보이네요.. ^^;;

function latest_reply($skin_dir="", $bo_table, $rows=10, $subject_len=40, $options="")
{
global $g4;

if ($skin_dir)
$latest_skin_path = "$g4[path]/skin/latest/$skin_dir";
else
$latest_skin_path = "$g4[path]/skin/latest/basic";

$list = array();

$sql = " select * from $g4[board_table] where bo_table = '$bo_table'";
$board = sql_fetch($sql);

$tmp_write_table = $g4['write_prefix'] . $bo_table; // 게시판 테이블 전체이름
// $sql = " select * from $tmp_write_table where wr_is_comment = 0 order by wr_id desc limit 0, $rows ";
$sql = " select * from $tmp_write_table where wr_is_comment = 0 order by wr_reply, wr_id desc limit 0, $rows ";

//explain($sql);
$result = sql_query($sql);
for ($i=0; $row = sql_fetch_array($result); $i++)
$list[$i] = get_list($row, $board, $latest_skin_path, $subject_len);

ob_start();
include "$latest_skin_path/latest.skin.php";
$content = ob_get_contents();
ob_end_clean();

return $content;
}

제작의뢰 게시판에 글 적었습니다.
제작후 스킨방에 올려서 함께 나누도록 하겠습니다.

답도 못드린건데 체택되었네요.. 감사합니다.. 이런...제작의뢰[아깝..ㅡㅡ;; 사람참간사하죠..쩝.]를 하셨군요... 오늘에야 확인되서.. 확인해볼라구 했더니... 거기다..공개까지.. 대단한 그누정신이시네요..^^*

http://www.sir.co.kr/bbs/tb.php/g4_tiptech/11019
이곳에 관련정보를 올렸습니다. 개미인간님께서 해주신 내용이 맞는 답변이셨습니다. ^^