1. 사이트를 호스팅 하는 서버를 다른 곳에서 구입하여 사용하고 계신가요?
호스팅 ID가 다르다면 각각의 ID와 pass를 입력하시면 서로 연관되지 않게, 별도로 운영하실 수 있습니다.

2. 직접 서버를 운영하실 경우에도 말씀하신 것 처럼 새 DB를 만든 뒤 그를 사용하면 됩니다.

3. DB도 같은 것을 사용하신다면 굳이 보드를 하나 더 설치하실 필요 없이 그룹을 나누어 사용하셔도 될 듯 합니다.

A사이트와 B사이트의 서버 정보를 알 수 없어 이 정도밖에 답을 드릴 수 없네요.
하지만 위의 셋 중의 하나를 택하신다면 대부분의 경우 통용이 되리라 생각합니다.

A사이트와 B사이트 호스팅 서버하고 아이디 패스워드는 같구요

A사이트에서 사용하는 그누보드 DB가 A 라고 한다면

B에 사용하려고하는 그누보드의 DB를 B라고 하면

A사이트와 B사이트가 호스팅서버와 아이디 패스가 같아도

상관없이 A사이트의 그누보드 DB자료들은 그대로 보관이 될까요?;

DB를 두 개 받으셨다면 A보드와 B보드를 담는 공간이 다르기 때문에 그대로 보관이 됩니다.
하지만 접속하는 DB의 ID와 pass마저 같다면 보드를 새로 설치하셔도 그룹을 나누는 것 이상은 기대하기 힘들겠네요.

아~답변감사드립니다...(_ _)꾸벅

그런데, 호스팅을 하나 받으실 경우 DB도 한 개만 주지 않나요?