콘솔에서 사용하는거구요..
폴더지정시 해당폴더의 모든 하위폴터는 지정하신 인코딩셋으로 변경이 됩니다.
사용법은 vi로 열어 보시면 아실수 있을겁니다.

#!/bin/sh

# Maintainer : Chan Hwang (innuendo9@gmail.com)
# Last Modify : 2006.02.24
# 특정 디렉토리의 euckr 포맷을 utf8 포맷으로 일괄 변환한다
# 사용법: uni_change.sh 디렉토리명|파일명 [포맷형태]
# 주의사항 : 스크립트 구동전 반드시 백업을 하십시오

일괄적으로 utf8로 변환하실려면 이게 편하던데..
저희는 이걸로 변경 완료 했거든요..

※ 주의사항 : euc-kr의 파일들을 utf-8로 변경후 아주 많은 문제점들이 생길수 있으니 신중히 변경하시기 바랍니다.
(실예로 카드결제시스템, 실명인증등 euc-kr이 사용되는 플러그인들에 인자값을 잘 전달하지 못하여 웨디->뚦쀍에벌레~ 이런식으로 됩니다.
인코딩 함수나 iconv를 사용하여 그럭저럭 해결하고 있으나 웹브라우져의 post값으로 인자값을 전달할때 body테그에 onload로 값을 콜할때는 절때 않간다는.. 결국 euc-kr의 계정을 하나 더 만들고 php설정에서 해당 계정만 euc-kr을 사용하게 하여 utf-8의 값을 받아 해당계정페이지에서 인코딩후 다시
euc-kr플러그인을 사용하는 곳으로 보내주는 방식으로 해결을 봤다는.. ㅡ.ㅡ; )

DB를 utf-8로 쓰시고 파일들은 euc-kr로 쓰는 방안이 팁란에 올라와 있던것 같습니다.
참고 하시길..