위 링크의 소스를 그대로 사용하신다고 하면 

if($bo_table!="제외하고 싶은 게시판 명")
{
    $filters = explode(",",$board[bo_1]);
    for ($i=0; $i<count($filters); $i++) {
        $s = trim($filters[$i]); // 필터단어의 앞뒤 공백을 없앰
        if (stristr($wr_subject, $s)) {
        alert("제목에 금지단어(\'{$s}\')가 포함되어 있습니다.");
        exit;
        }
        if (stristr($wr_content, $s)) {
        alert("내용에 금지단어(\'{$s}\')가 포함되어 있습니다.");
        exit;
        }
    }
}

이렇게 사용하시면 되구요. 여러개의 게시판을 예외 처리하고자 하실땐 

$_temp_bo_table=array("제외 게시판1", "제외 게시판2", "제외 게시판3");
if(!in_array($bo_table, $_temp_bo_table))
{
    $filters = explode(",",$board[bo_1]);
    for ($i=0; $i<count($filters); $i++) {
        $s = trim($filters[$i]); // 필터단어의 앞뒤 공백을 없앰
        if (stristr($wr_subject, $s)) {
        alert("제목에 금지단어(\'{$s}\')가 포함되어 있습니다.");
        exit;
        }
        if (stristr($wr_content, $s)) {
        alert("내용에 금지단어(\'{$s}\')가 포함되어 있습니다.");
        exit;
        }
    }
}

이렇게 사용하시면 될것 같습니다.