phpMyAdmin 에서 다음과 같이 인덱스를 변경해줘야 합니다. (갤러리 게시판 예제)

ALTER TABLE `g4_write_gallery` DROP INDEX `wr_num_reply_parent`;
ALTER TABLE `g4_write_gallery` DROP INDEX `wr_is_comment`;
ALTER TABLE `g4_write_gallery` ADD INDEX `index_bbs_list` (`wr_is_comment`, `wr_num`, `wr_reply`);
ALTER TABLE `g4_write_gallery` ADD INDEX `index_co_list` (`wr_parent`, `wr_is_comment`, `wr_comment`, `wr_comment_reply`);

다음과 같은 내용으로 파일을 만들어 1회 실행하시면 됩니다. 게시판 id 부분은 수정해주셔야 하고요.

<?
include_once("./_common.php");

// 게시판 id
$bo_table = "gallery";

// index 변경
@sql_query(" ALTER TABLE `{$g4['write_prefix']}{$bo_table}` DROP INDEX `wr_num_reply_parent` ", FALSE);
@sql_query(" ALTER TABLE `{$g4['write_prefix']}{$bo_table}` DROP INDEX `wr_is_comment` ", FALSE);
@sql_query(" ALTER TABLE `{$g4['write_prefix']}{$bo_table}` ADD INDEX `index_bbs_list` (`wr_is_comment`, `wr_num`, `wr_reply`) ", FALSE);
@sql_query(" ALTER TABLE `{$g4['write_prefix']}{$bo_table}` ADD INDEX `index_co_list` (`wr_parent`, `wr_is_comment`, `wr_comment`, `wr_comment_reply`) ", FALSE);

echo "변경 완료";
?>