질문의 내용을 잘 모르겠군요.
mysql버전만 올린다면 rwapm 최신버전을 다운 받아서 업그레이드하시면 됩니다.
http://kldp.net/projects/rwapm/

mysql업그레이드때문에 문제가 될 수 있으니

중요::  mysqldump -u아이디 -p비밀번호 데이터베이스명 > 아이디.sql로 백업을 받아 둡니다.

1, 이전 버전은 폴더 전체를 다른이름으로 바꾼 후에,
2. apm 설정을 맞추어 주시고, phpmyadmin으로 로긴을 확인한 다음, 빠져 나와서,
3. 이전의 mysql data폴더중 mysql만 빼고 복사 해 넣어 주고,
4. 다시 phpmyadmin에 들어 와서 db가 다 올라 왔는지 확인 합니다.
5. 그누보드를 띄워서 로긴이 되는지 확인합니다.
  로긴이 않되면, phpmyadmin에서 관리자의 암호를 다시 맞춘 다음, 로긴합니다.

6. 그래도, 그누보드가 뜨지 않는다면, 위에서 백업 받은 sql을 복원합니다.
mysql -u아이디 -p비밀번호 데이터베이스명 < sample.sql