변경된 코드로 수정해보았습니다. 기존과 동일하게 열리는데 인풋박스에 값이 안들어가고 창도 안닫혀요.ㅠㅠ.
해당 스크립트도 변경된거 같은데. 부탁드립니다.

주소검색 버튼은 뽁스님이 알려주신데로
<button type="button" class="btn_frmline" onclick="win_zip('fregisterform', 'mb_zip1', 'mb_zip2', 'mb_addr1', 'mb_addr2', 'mb_addr3', 'mb_addr_jibeon');">주소 검색</button><br>
로 수정하였구요..

아래 코드는 그누보드에서 공식적으로 올려주신 수정코드데로 삽입되어있구요
결과는 위에 말씀드린데로 해당 인풋박스에 값이 들어가지 않구요, 주소창이 사라지지 않는 문제가 있네요.. 조금만 더 살펴봐 주시면 감사합니다.^^

/**
 * 우편번호 창
 **/
/* 다음 주소검색 수정으로 인한 주석처리
var win_zip = function(href) {
    var new_win = window.open(href, 'win_zip', 'width=616, height=760, scrollbars=1');
    new_win.focus();
}
*/
// 다음 주소검색 추가 시작
var win_zip = function(href) {
    if(typeof daum === 'undefined'){
        alert("다음 juso.js 파일이 로드되지 않았습니다.");
        return false;
    }

    var url_to_array = function(url) {
        var request = [];
        var pairs = url.substring(url.indexOf('?') + 1).split('&');
        for (var i = 0; i < pairs.length; i++) {
            var pair = pairs[i].split('=');
            request[decodeURIComponent(pair[0])] = decodeURIComponent(pair[1]);
        }
        return request;
    }

    var param = url_to_array(href),
        frm_name = param['frm_name'],
        frm_addr1 = param['frm_addr1'],
        frm_addr2 = param['frm_addr2'],
        frm_addr3 = param['frm_addr3'],
        frm_zip1 = param['frm_zip1'],
        frm_zip2 = param['frm_zip2'],
        frm_jibeon = param['frm_jibeon'],
        of = document[frm_name];

    new daum.Postcode({
        oncomplete: function(data) {
            // 팝업에서 검색결과 항목을 클릭했을때 실행할 코드를 작성하는 부분.
            // 우편번호와 주소 정보를 해당 필드에 넣고, 커서를 상세주소 필드로 이동한다.
            of[frm_zip1].value = data.postcode1;
            of[frm_zip2].value = data.postcode2;
            of[frm_addr1].value = data.address1;
            of[frm_addr2].value = "";
            of[frm_addr3].value = "";

            if( data.addressType == "R" ){  //도로명이면
                of[frm_addr3].value = data.address2;
            }
            if(of[frm_jibeon] !== undefined){
                of[frm_jibeon].value = data.addressType;
            }

            of[frm_addr2].focus();
        }
    }).open();
}

//다음 주소검색 추가 끝

<button type="button" class="btn_frmline" onclick="win_zip('fregisterform', 'mb_zip1', 'mb_zip2', 'mb_addr1', 'mb_addr2', 'mb_addr3', 'mb_addr_jibeon');">주소 검색</button>
주소검색 버튼을 위의 소스로 하려면 common.js 파일에 있는 win_zip 부분도 수정해야 됩니다.
5.0.16 이상 버전을 받아서 js/common.js, skin/member/basic/register_form.skin.php 파일 비교해보세요.

네 감사합니다.^^ 복받으세요~ㅎㅎ

뽁스님! 상위버전으로 수정했더니 시원하게 되네요.. 다시한번 은혜감사합니다.^^

감사합니다.^^