파일은 있습니다.
익스플로러로 다운로드 시도하면 정상적으로 다운로드 되거든요..

용량이 어느정도해요?

용량은 파일마다 좀 다른데 4MB 미만도 있고 20MB 근접하는것도 있어요
용량제한은 21MB 까지 수정해놓은 상태 입니다

음.. 일단 추측으로 한다면 크롬에서 제제를 하는경우도 있고
아니면 php 다운로드 파일에서 경로나 사이즈떔에 그럴경우도 있어요
분석 해봐야 알것 같아요

혹시 data 폴더에서 퍼미션 707로 됐는지 다시한번 체크 해보세요

말씀주신 부분은 다 체크 해봤는데 해당사항 없더라구요
파일명 긴것, 짧은것, 확장자, 사이즈 다 다양하게 시도해봤는데 안됩니다 ㅠㅠ 흑

해결됐나요?

if(preg_match("/msie/i", $_SERVER['HTTP_USER_AGENT']) && preg_match("/5\.5/", $_SERVER['HTTP_USER_AGENT'])) {
    header("content-type: doesn/matter");
    header("content-length: ".filesize($filepath));
    header("content-disposition: attachment; filename=\"$original\"");
    header("content-transfer-encoding: binary");
 } else if (preg_match("/Firefox/i", $_SERVER['HTTP_USER_AGENT'])){
    header("content-type: file/unknown");
    header("content-length: ".filesize($filepath));
    //header("content-disposition: attachment; filename=\"".basename($file['bf_source'])."\"");
    header("content-disposition: attachment; filename=\"".$original."\"");
    header("content-description: php generated data");
 } else {
    header("content-type: file/unknown");
    header("content-length: ".filesize($filepath));
    header("content-disposition: attachment; filename=\"$original\"");
    header("content-description: php generated data");
 }
 header("pragma: no-cache");
 header("expires: 0");

파일 하단에 이부분을 말씀하시는건가요?

예~~