// ［ｃｏｄｅ］～［／ｃｏｄｅ］ 부분만 원래의 문자열을 유지하는 방법 문의인가요?
// 구현 방법이야 다양하겠으나, 옛날 옛적에 코드 하이라이트 구현한다고 작성했던 코드가 떠오르는군요.
// 방법은 굉장히 단순합니다. 간단하니까 예제 코드 참고로 추가합니다.
 
// 예를 들어 아래처럼 입력이 되었다고 가정 - 편의상 줄바꿈 생략, <code>~</code>로 표현
$html = '내용1<code>첫 번째 블록</code>내용2<code>두 번째 블록</code>내용3';

preg_match_all('#<code>.+?</code>#s', $html, $matches); // 정규식을 이용해 코드 블록 구하기
 
$change_a = []; // A->B 치환용
$change_b = []; // B->A 치환용
 
foreach ( $matches[0] as $k=>$v ) { // 블록 반복
    $key = '[CODE'.$k.']'; // 내용에 사용되지 않을 구분자 문자열 추천
    $change_a[$v] = $key;
    $change_b[$key] = $v;
}
 
// 본래의 내용에서 코드 블록 부분의 문자열을 먼저 치환
$html = strtr($html, $change_a); // 내용1[CODE0]내용2[CODE1]내용3 ... 이런 내용이 됩니다.
 
// HTML Purifier 를 적용해주고
// : 생략
// $html = $purifier->purify($html);
 
// 다시 코드 블록을 원래의 문자열로 치환
$html = strtr($html, $change_b); // 내용1<code>첫 번째 블록</code>내용2<code>두 번째 블록</code>내용3
 
// 어때요? 참 쉽죠?