링크가 없으니 알 수 없지만
list.skin.php 페이지에서 자바스크립트 에러가 있지않을까 싶습니다
팝업창을 띄운 후 복사인지 이동인지 값을 넣어서 팝업창으로 submit하는 부분이
작동하지 않는 것이 이유니까말이죠

뷰페이지에서 이동시 이동완료 메세지까지 되고 팝업창이 닫히지 않는 것도 역시
뷰페이지에서 발생한 자바스크립트 오류 때문일 것으로 추측 됩니다
move_update.php 마지막에 보면 아래와 같이 되는데
alert("{$msg}");
<----------------------여기까지만 작동 되고 아래 부분은 작동 되지않는 것입니다
따라서 팝업창 닫기 부분이 실행이 안되는 것입니다
opener.document.location.href = "{$opener_href}"; <---이 부분에서 에러가 나는 것입니다
window.close();

스킨의 자바스크립트 뿐만 아니라 페이지 전체의 어느 자바스크립트 중에서 에러가 발생했을 수도
있습니다
리스트페이지와 뷰페이지 모두 에러가 있는 것으로 보아서
스킨 외의 곳에서 자바스크립트에서 에러가 발생하는 것 같습니다

FF로 페이지를 열어서 오류부분 체크해보세요