저도 같은 증상으로 고민좀 했었습니다.
원인은 http://domain.com/blog/rss 로 인식을 하게 해야합니다.

blog 디렉토리 경로를 없애버리면 http://domain.com/rss 로 인식해버리기 때문에 페이지를 표시할 수 없다고 나옵니다.

저의 경우 php 문외한이라서 스킨에서 수정하는 방법을 사용했습니다.

/skin/blog/블로그스킨/sidebar.skin.php에서 수정합니다.

/*-----------------------------------------------------------------------
    태그구름
-------------------------------------------------------------------------*/

<a href="<?=get_tag_cloud_url()?>"> 를
<a href="<?=$blog_url?>/blog/<?=$mb_id ?>/tags"> 이렇게 수정

/*-----------------------------------------------------------------------
    RSS
-------------------------------------------------------------------------*/

<a href="<?=$current['rss']?>"> 를
<a href="<?=$blog_url?>/blog/<?=$mb_id ?>/rss"> 게 수정하여 사용하고 있습니다.


문제는 스킨을 추가할 때마다 sidebar.skin.php 를 수정해줘야 한다는 것이 흠이지만... -_-

뭔가 대책을 세우신 분들은 팁을 공개해 주심이... -_- 킁...