index.php 페이지를 수정하셔서 쓰시는 거라면..
해당 소스를 열어서 보시면

for ($i=0; $row=sql_fetch_array($result); $i++) {
    // 이 함수가 바로 최신글을 추출하는 역할을 합니다.
    // 스킨은 입력하지 않을 경우 관리자 > 환경설정의 최신글 스킨경로를 기본 스킨으로 합니다.

    // 사용방법
    // latest(스킨, 게시판아이디, 출력라인, 글자수);
    echo latest("basic", $row['bo_table'], 10, 70);
    echo "<p>\n";
}

와 같은 부분이 있습니다.

전부 지워주시고,
최근글을 뿌려주실 부분에,

<?=latest("basic", "1번게시판 이름", 10, 70);?>
<?=latest("basic", "2번게시판 이름", 10, 70);?>

으로 바꿔주시면 됩니다.

참고 : 1번게시판 이름, 2번게시판 이름 이라고 되어있는 부분을 그림자하늘님께서 만드신 게시판 이름으로 바꿔주셔야 합니다.