rolo님께서 지적해 주신 부분은 숙제로 남겨두고,,
write.php수정 부분을 제외한 wirte.skin.php에서 처리하는 부분을 정리해보았습니다.
도움주신 고수님들께 감사의 말씀 드립니다.

//################## 이미지 파일만 업로드되도록 체크 ##################
//http://www.sir.co.kr/bbs/tb.php/g4_qa/19571 사랑@마눌님 팁
//알려진 문제, 글 수정시 1번파일의 삭제를 막지못함
<? $file_ext = "jpg|jpeg|gif|png";  ?>
var file_ext = "\\.(<?=$file_ext?>)$";
var tmp_file = document.getElementsByName("bf_file[]");
//글 수정이 아니라면
<? if ($w != "u") { ?>
if (tmp_file[0].value == '') {
    alert("첫번째 파일이 없습니다.\n확장자 (<?=$file_ext?>)인 파일만 업로드 가능합니다.");
    tmp_file[0].focus();
    return;
    }

for (i = 0; i < tmp_file.length; i++) {
    if (tmp_file[i].value != '') {
        if (!((new RegExp(file_ext, "i")).test(tmp_file[i].value))) {
            alert("확장자 (<?=$file_ext?>)인 파일만 업로드 가능합니다.");
            tmp_file[i].focus();
            return;
            }
        }
    }
<?
}
?>

//글 수정이라면, write.php에서 1번파일에 대한 삭제방지를 위해 체크박스 딤드 - zzzz님
//### 원본수정 ### http://www.sir.co.kr/bbs/tb.php/g4_qa/20118 write.php에서 처리 ".($i==0?'disabled':'')."
//대체파일 업로드할때 지정된 이미지 파일만 업로드되도록 체크
<? if ($w = "u") { ?>
for (i = 0; i < tmp_file.length; i++) {
        if (tmp_file[i].value != '') {
            if (!((new RegExp(file_ext, "i")).test(tmp_file[i].value))) {
                alert("확장자 (<?=$file_ext?>)인 파일만 업로드 가능합니다.");
                tmp_file[i].focus();
                return;
            }
        }
    }
<?
}
?>

//step2
//운영중에 스킨을 변경하는 등, 만일의 경우를 대비해 1번파일이 없는 경우라면 지정파일인지 체크
<?
if ($w == "u") {
    $file_check = $file[count] ;

    if (($file_check) <= 0) { ?>

        if (tmp_file[0].value == '') {
        alert("첫번째 파일이 없습니다.\n확장자 (<?=$file_ext?>)인 파일만 업로드 가능합니다.");
        tmp_file[0].focus();
        return;
        }
<?
  }

}//if

?>

//################## 이미지 파일만 업로드되도록 체크 끝 ##################