데이터폴더만 놔두고 덮어 씌우면 됩니다만,
디자인을 어느정도는 아셔야 수월 할 겁니다.

저같은 무작정디자인파들은 모양을 안가리니 그냥 씁니다만, 이쁘게 하실려면 디자인을 공부하셔야 할겁니다.
아니면 상단메뉴의 제작의뢰를 하시는 것도 한 방법이겠습니다.

그누보드 삭제는 어지간 하면 하지 마십시오.
디렉토리명만 바꾸서 바꿔치기하면서 하는게 안전합니다.

예를 들면,

bbs -> bbs_org
adm -> adm_org
등으로 바꾸시고,
그누보드 다운로드에서 최신버전을 ftp로 업로드,
history의 주석을 읽으면서 업그레이드.

필요한 파일들을 하나씩 수정.

완료후 *_org 디렉토리들을 삭제.

한꺼번에 다할 수는 없으니, 급하게 생각지 않으시는게 정신건강에 도움이 된답니다.

1. 루트에다가 적당한 이름으로 폴더 하나 만든다.
2. 그누보드 최신버전을 새로 만든 폴더에 올린다.
3. 설치과정은 생략하고, 운영중인 홈에서 dbconfig.php 파일을 복사하여 새로 만든 폴더에 넣어주고 ,install 폴더는 삭제한다.
4. 도메인/새로만든폴더명으로 접속하면서 새롭게 디자인한다.
5. 디자인이 완료되면 예전홈의 데이터 폴더를 새로만든 폴더로 옮겨준다.
6. 예전홈의 보드를 삭제한다.
7. 새로 만든 폴더내의 모든 폴더및 파일들을 루트폴더로 옮겨준다.

이런 절차로 만드시면 더 수월할것 같습니다...^^